یکی از چالش‌های عمده در صنعت لبنیات و برخی صنایع وابسته به شیر از جمله صنعت شیرینی و شکلات و بستنی و... عدم توازن در زنجیره مواد اولیه و قیمت‌گذاری در این صنایع است. یکی از محصولاتی که در حوزه قیمت‌گذاری با چالش‌های زیادی روبه‌رو است و به گواه فعالان صنایع‌غذایی به چالشی جدی در صنایع مرتبط تبدیل ‌شده، شیر خام است. تعیین قیمت شیر بدون استفاده از روش‌های استاندارد از یک‌سو و تغییرات مداوم قیمت این محصول از سوی دیگر در خلال سال‌های اخیر همواره فعالان صنایع وابسته را به‌خصوص در صنعت لبنیات با مشکل روبه‌رو کرده و این در حالی است که این نوسانات در غالب اوقات در قیمت تمام ‌شده محصولات لحاظ نشده است.

سخنگوی انجمن صنایع فرآورده‌های لبنی با تاکید بر اینکه شیرخام ۶۵ درصد هزینه تولید محصولات لبنی را شامل می‌شود، گفت: در مصوبه جدید ستاد تنظیم بازار قیمت خرید هر کیلوگرم شیرخام از دامدار ۶ هزار ۴۰۰ تومان تعیین شده است که با در نظرگرفتن هزینه حمل قیمت تحویل درب کارخانه لبنی به ۶ هزار ۶۰۰ تومان خواهد رسید، با این شرایط قیمت محصولات لبنی نیز حدود ۷۰ درصد افزایش را تجربه خواهد کرد.